原冀察战区游击部队于1940年3月退出河北境内,以鲁西为基地,继续游击。1942年春,战区总司令部仍位于鲁西濮县(今属濮阳县)。战区总司令高树勋兼任第39集团军总司令,辖新编第8军(高树勋兼军长)、第69军(米文和)。4月下旬,日军分途向高部进攻。高部全力反击,相持至5月14日,战区主力向菏泽、观城间转移。总司令部退至定陶以东的侯集。6月初,日军分三路向单县东北的曹马集一带围攻,砀山日军北进,均被击退。3日,高军一部从杨集车站(虞城东)以西越陇海铁路南移。次日,高部在夏邑千佛阁将日军击退,自身伤亡1100人。此后,战区留置第181师于单县、丰县地区,并指挥鲁西及砀山、丰县地方团队继续在鲁西游击,其余各部越过陇海路向皖北涡阳转移。汤恩伯所部向陇海路沿线攻击,予以接应。
(二)第一战区太行山游击区
1942年春至1944年秋,冀察战区司令长官由第一战区司令长官蒋鼎文兼任。第24集团军(庞炳勋,后蒋鼎文兼任)之新编第5军(孙殿英)、第40军(先庞炳勋兼任,后马法五兼)、第27军(刘进兼任)在太行山、中条山一带苦战。
1940年后,第一战区太行山根据地实施游击作战,击退日军数次进攻。自1941年中条、太岳两游击根据地先后被日军攻陷,太行山成为冀鲁豫边区国民政府军唯一据点。1942年6月11日,日军向太行山国民政府军队围攻。太行山部队在林县、陵川、临淇(鹤壁西)、东姚集(鹤壁西南)各据点附近与日军激战。日军付出极大代价,虽一度攻陷各据点,但待日军兵力分散后,太行部队利用优良地形和山区民众之协助,于7月上旬逐次反攻,深入之敌被迫撤退,日军占据之各据点相继收复。7月15日恢复战前态势。
1943年4月,日军抽调5万余兵力、50余架飞机,集中于太行山四周。其华北方面军司令官冈村宁次亲至新乡指挥,对太行山根据地围攻。时第24集团军庞炳勋指挥马法五军于林县附近,孙殿英军于临淇镇东南地区,刘进军于陵川方面,共同迎击来犯之敌。各路守军奋勇抵抗,终因兵力相差悬殊,陵川于4月17日晚失守。庞集团军损失颇重。22日,日军攻陷林县、临淇二据点,同时陵川日军亦步步深入,日军合围态势形成。为保存实力,庞集团军以一部分留置山区游击,主力向外转移。新编第5军军长孙殿英在临淇镇以西中敌埋伏而被俘,所部大部被日军冲散。刘进军、马法五军与日军苦苦周旋,继续游击。庞集团军总部因突围,与各部失去联络。28日,刘进军最后据点夺火镇(陵川南)复陷。马法五军坚守多日的东姚集亦于4月30日被迫放弃。
日军搜索山区。时庞炳勋因腿部旧创复发,行动不便,避居临淇镇附近的东峡垴,5月6日为敌侦知而被俘,被挟往新乡。日军命写招降书招降第40军副军长李振清,庞氏拒绝。日军伪作庞令,又为李振清军全体将士坚拒。据白崇禧回忆:庞炳勋在新乡密派亲信人员告第40军李振清军长,协同第27军刘进部队继续游击。李振清军协同刘进军继续作战。
1943年7月上旬,日军对守军作第三次猛攻。此时马法五军已调河南整补,只留刘进军于太行山孤军苦斗。军事委员会特命第27军军长刘进为太行山游击总司令。该军仍回旋于陵川一带与平顺、壶关间山区,继续游击。至7月10日,该军主力被日军各个包围攻击,伤亡很大。刘进率部突出重围,绕攻敌后。该部向西突进,与八路军一部遭遇摩擦。刘进率该军第46师主力绕经夺火镇向西突进,沿途不断与八路军遭遇,发生摩擦。军事委员会乃令该军撤回黄河南岸。8月1日,部队南渡完毕。至此,国民政府军在冀、察两省基本上已无活动。太行山区只留有八路军与日军对峙。
(三)第一战区河南地区
第一战区独立游击第8支队分别由董良俭、王国然任正、副司令,曾活跃于新乡一带,在平汉路沿线开展游击,后向太行山南麓转移。司令部设于辉县石门口,1941年初迁至修武县柿园村。夏,该部集中到荥阳县史村,改编为独立第16支队,调郑州以北花园口、京水口一带,执行邙山以东河防任务。1942年冬,第一战区司令长官部将其改编为河北挺进军,再次进入黄河北岸游击,刘国勋与王国然分任正、副指挥。其余各部,除第1团编入汤恩伯军第12旅外,扩编为13个支队。王国然率原第8支队之张昆峰部进入封丘、长垣、滑县、原武(今原阳县西)、阳武(今原阳)等县活动。第10支队岳得功部在获嘉、武陟一带与日军多次激战。武陟汤王堤村一战,击毙日军第35师团关根井一郎联队长,毙伤日伪军数百人。1944年春,岳得功在嵩山一带组织“国民革命军胜利集团军”。第一战区司令长官胡宗南任其为第17纵队司令,河南省政府主席刘茂恩令岳兼任郑州专区十余县联防抗日指挥官。岳率部随王国然在郑州、荥阳、密县边区继续抗日。抗战胜利时,胡宗南曾派岳为先遣军司令入郑州受降。
1944年8月下旬,豫中会战后,临汝县县长毛汝林联合邻近5县游击队,兵力约1000人,以半礼为中心的地区活动。10月10-12日,第12军(贺粹之)暂编第55师(王守正)正拟攻击伊阳(今汝阳),与日军发生遭遇战。
(四)第二战区
太平洋战争爆发后,第二战区为掩护部队整训,准备反攻,随时以游击战的方式对敌袭击。1942年3月27日,蒋介石手令各战区设立混成破坏队,破坏敌伪建设,牵制敌伪兵力。5月,为突破日军对征运粮食的封锁,第二战区吕梁山根据地各部对日军展开反击。第34军军长王乾元率该军及第4游击纵队在荣河、猗氏、万泉、安邑、闻喜、夏县等地,施行广正面游击。6月间,王乾元军长负伤,第54师师长王凤山殉国。7月24日,暂编第43师新收编之王文虎部20余人潜入夏县地区内,与反正的伪军袭占夏县县城。
1943年3月27日,暂编第59师特工队潜入永济城内,焚坏日军仓库。
1944年2月1日,第二战区遵军事委员会令,派第61军梁培璜部及暂编第39师东渡汾河,经浮山进击上党,在浮山境内受阻。3月16日,军委会电令梁军速进长治,控置晋东;另以一部由稷山向晋南三角地带进袭,策应第一战区作战。4-5月间,梁军东进中与八路军遭遇,发生摩擦冲突。8月底,第二战区令史泽波军之第68师及挺进第2纵队进入浮山。浮山日军向战区东进各部攻击,梁培璜军之暂编第48师迎战不利,向浮山东南地区转移,伤亡与失踪共2000余名。
(五)第八战区
1941年12月,第八战区朱绍良遵军事委员会令,命伊克昭盟黄河右岸部队及大青山游击队深入敌后游击。绥(归绥)包(包头)日军不时进攻,绥远部队积极抗击。1942年6月6日,袁庆荣师在向马边湾增援途中与日军在万盛隆遭遇,激战伤亡甚重,日军联队长渡边战死。
第八战区绥远部队不断向日军袭击。1942年9月5日,五原东南的晋察绥边区挺进军(邓宝珊)骑兵第2纵队第4支队由五原东进,经固原、武川深入敌后,9月底到达察哈尔省张北、商都中间地区,与当地游击队会合,向敌袭击,11月初折返原防。
10月,傅作义在绥远省组织混成队,派遣官兵400余人混入敌占城镇机关,发动大规模暴动,不少人被敌捕获,多数人不惜牺牲,达成任务。
1943年2月14日,骑兵第5挺进纵队一部在武川西与敌战斗,诱击、伏击敌军。骑兵第1纵队第1支队击退日军黑石部和伪军对大青山游击根据地的联合进攻。3月,绥远安北等地游击队割断电线,使日军电信中断。6月上旬,新编第32师在包头西南击退日军进攻。大青山根据地游击部队反复击退日军优势兵力的围攻。
1944年9月,日军围攻大青山游击根据地,经分别阻击,予以击退。10月下旬,日军回窜。绥远部队积极开展对伪军的策反工作,亦取得不少成效。
(六)鲁苏战区
1942年春,鲁苏战区总司令部位于鲁南沂蒙山区内。牟中珩接任总指挥兼山东省政府主席,所部为第51军。该战区部队对日军袭扰,日军对之进行扫**。其时第51军内部发生分化。1942年8月4日,第111师旅长万毅发动师长常恩多投向八路军。是年冬,莱阳之暂编第12师遭日军围攻,加以与八路军之间发生摩擦,几乎全部覆灭。1943年2月18日,鲁南新编第四师师长吴化文投敌。
1943年5月12日,日军向沂蒙山区围攻。牟中珩军迎击,战至15日,沂水附近及蒙阴东北之守军向南突围,遭日军截击。牟军奋勇反击,杀伤日军甚多。19日,日军撤退。时八路军占领沂蒙山区,国共两军间发生摩擦,鲁南行署(设于安丘)主任秦启荣战亡。牟中珩军向皖北转移。牟中珩辞去山东省政府主席的兼职,何思源接任。山东省政府迁驻寿光县城。省政府指挥保安队张景月部两团向日军游击。
苏北方面,坚持抗日游击作战的国民政府军原有韩德勤、李明扬、李长江等部。自各部与进入苏北的新四军之间于1940年在泰兴黄桥、泰州姜堰、海安曲塘、宝应曹甸发生摩擦战斗后,战力削弱。1941年3月,高邮、宝应日军攻陷江苏省政府所在地兴化县城。韩德勤部人员向淮东转移。转移中,韩部在盐城附近与新四军粟裕部之间又发生了摩擦。
1943年2月13日,日军向第89军(顾锡九)发起进攻,主力猛攻凤谷、车桥(淮安东)两据点。经顾锡九军各部分别阻击,激战至20日。守军除留置一部于原地阻击日军外,主力分向阜阳及淮泗区转移,沿途复遭日军袭击,激战月余,伤亡很重。韩德勤部在新四军掩护下大部退入淮海抗日根据地。
继而,新四军彭雪枫师、黄克诚师与鲁苏战区韩德勤副总司令部、独立第6旅、保安第3纵队之间又发生摩擦冲突。独立第6旅旅长李仲贤、保安第3纵队队长王殿华战死。官兵伤亡3000人以上。至3月中旬,韩部转移至安徽省阜阳附近。至此,国民政府军苏鲁战区在苏北的根据地全部丧失。苏北敌后只有新四军活动。
(七)第五战区大别山游击根据地
第五战区鄂皖根据地策应第三次长沙会战,于1941年12月19日发起广泛游击,平汉路附近各部向应城、随县、安陆、花园、孝感、白螺矶等地袭击,津浦路附近李仙洲军等部分向合肥、含山、滁州、怀远、蒙城、淮阳等地袭击,打击当面之敌,破坏交通。
1942年夏至12月中旬,大别山以南地区部队不断向长江沿岸挺进,予日军威胁甚大。日军乃向大别山以南各城镇大举进犯,并改派冢田攻为驻武汉第11军司令官,担任该方面作战指挥。冢田攻于12月18日由南京飞汉口履任,座机经太湖县张家坪上空时,被中国挺进部队第138师击落,冢田与同机9名高级军官毙命。日军为报复,并寻觅其残骸,于23日开始对大别山根据地进攻。李品仙集团军各部在浠水、英山、罗田、麻城、立煌(今金寨)、商城逐次抵抗。12月下旬,日军先后攻陷麻城、罗田、浠水、广济、黄梅、宿松、太湖、潜山等地。至此,大别山以南各重要城镇被日军攻陷。
日军向北进攻,攻占光山、潢川、商城、立煌、桐城。各地守军与日军激烈战斗。1943年1月2日,日军攻陷立煌后,第五战区部队乘日军疲惫,开展反攻。日军5日西进,6日陷固始、商城,一部经英山向太湖东进。刘和鼎军与莫树杰军向商城反攻,刘汝明军第143师经平汉路向潢川挺进,以作策应。日军乃弃商城、固始,经光山、潢川西进。莫树杰军跟踪追击。信阳日军千余人东进罗山,接应西进日军,退向信阳。