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第136章 问道与论道求订阅求月票（第2页）

空气中飘着一股咖啡和黄油面包的混合味道。

林允宁正站在一张破旧的台球桌旁，手里拿着一根磨损严重的球杆，面前摆着一个标准的开球三角。

程新竹风风火火地冲了进来，看到这场景有点懵。

“你叫我来，该不是陪你打台球吧?”

“你看。”

林允宁没回答，他俯下身，一杆大力开球。

“砰”的一声闷响，白球撞入球堆，彩球四散开来，滚向桌面各处，最终停在不同的位置。

“这就是我们之前在做的事，”

林允宁直起身，用球杆指了指桌面上混乱的彩球，“我们想通过观察这些球最终停在哪，来反推出开球时，白球的速度和角度。这是‘观相’。”

他走到桌边，把所有彩球重新摆回三角形。

“但我们忽略了一点，”

他再次俯身，这一次，他用了一个完全不同的角度和力道，轻轻一推。

白球慢悠悠地滚过去，踏开球堆，彩球们互相碰撞，走出了完全不同的轨迹，最终停在了另一组位置上。

“同样的开球状态，只要中间的‘路径’稍微有点不同，终点就天差地别。”

林允宁放下球杆，看着程新竹。

“构象异质性’不是需要被消除的噪声，它本身就是蛋白质错误折叠‘路径”的痕迹!我们一直想看清终点，却忘了去记录过程。”

程新竹的眼睛亮了。她快步走到台球桌旁，拿起一颗红球。

“我懂了。。。。。。所以，我们不应该把几万张图叠加平均，那会抹掉所有的路径信息。我们应该把它们。。。。。。串起来?”

“对。”

“但这怎么做?"

程新竹的眉头又皱了起来，“每一张图都是一个独立的快照，我们怎么知道哪一张在前，哪一张在后?它们之间没有时间顺序啊!”

“所以我们要放弃‘重建”的思路，”

林允宁领着她，走到旁边一台老旧的桌面足球机前，“我们要‘计算”。’

他拨动了一下红方的小人，塑料小球在小小的绿茵场上滚动。

“我们不需要知道每一帧画面的顺序。我们有物理规律。我们可以建立一个能量模型，把所有可能的蛋白质构象，都看作是能量平面上的一个个山谷”。蛋白质的折叠过程，就是小球在这个能量平面上滚动的过程。

“我们要做的，不是去拼凑小球最终掉进了哪个山谷，而是用物理学家的武器，去计算出它最可能走的那条下山路径”。从健康的‘山顶，到病变的‘谷底，能量最低，最省力的那条路。”

林允宁的声音不大，但每一个字都像锤子，敲在程新竹的心上。

“这。。。。。。这是计算生物学的范畴了。”

程新竹喃喃自语，“这需要巨大的计算量，而且。。。。。。我们怎么知道那个能量模型是对的?”

“这个我来想办法，”

林允宁笑了笑，“我们可以把你的几万张终点图像，作为约束条件，来反推那个能量地形图。这叫‘逆问题’。’

两人就细节问题一路聊着，在大厅中漫无目的地并肩而行。